AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3対応製品

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、 NextSeq 550システムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください

ライブラリー調製

パネルの説明

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3は、キナーゼドメインやDNA修復に関与する遺伝子など、主要ながん遺伝子をカバーしています。

コンポーネント プール数 濃度 アンプリコン数 平均アンプリコン長(bp) 平均ライブラリー長(bp)
DNA 2 2X 3781 105 245
RNA 2 5X 867 99 239
ライブラリー調製およびインデックスキット

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3プロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。

サンプル数

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3プロトコールでは、サンプルごとに1つのDNAと1つのRNAライブラリーが生成されます。 サンプルはDNA、RNA、またはペアになります。このプロトコールのサンプルはペアになっています。 サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーは、シーケンスに必要な末端を持つ独自のDNAまたはRNA調製物です。

適切な数のサンプルを調製するには、以下のキット数と組み合わせが必要です。

サンプル数 24サンプル 96サンプル 384サンプル
ライブラリー数 48ライブラリー
(24 DNA、24 RNA)
192ライブラリー
(96 DNA、96 RNA)
768ライブラリー
(384 DNA、384 RNA)
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 1 4 16
AmpliSeq Library PLUS for Illumina 24反応キット2個 96反応キット2個 2 384反応キット
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) 1 2 8
cDNA合成 1 1 4

シーケンスガイドライン

以下のシステムと試薬キットを使用して、Sequence AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3ライブラリーをシーケンスします。

DNAサンプル
システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq High Output Reagent Kit 3
MiSeq システム MiSeq Reagent Kit v3 3
NextSeqシステム NextSeq Mid Output Kit v2 16
  NextSeq High Output Kit v2 48
RNAサンプル
システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 24
  MiniSeq High Output Reagent Kit 80
MiSeq システム MiSeq Reagent Nano Kit v2 3
  MiSeq Reagent Micro Kit v2 12
  MiSeq Reagent Kit v2 48
  MiSeq Reagent Kit v3 80
DNAサンプルとRNAサンプルの組み合わせ 
システム 試薬キット ランごとのDNAサンプル ランごとのRNAサンプル ランあたりのサンプルの組み合わせ
MiniSeqシステム MiniSeq High Output Reagent Kit 3 3 6
MiSeq システム MiSeq Reagent v3 3 3 6
NextSeqシステム NextSeq Mid Output Kit v2 16 16 32
NextSeq High Output Kit v2 48 48 96