Illumina DRAGEN Bio-IT Platform Training

  • Training Videos

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  • Illumina DRAGEN Bio-IT Platform: What is new with version 3.9 updates

    Recorded Webinar (August 2021) | Tune in to our upcoming webinar to learn about the latest DRAGEN features and enhancements with the v3.9 release.  Significant highlights include the availability of DRAGEN on Microsoft Azure, RNA variant calling, Homologous Recombination Deficiency (HRD) for WGS data, graph genome accuracy improvements (most notably in the MHC region), and expanded capabilities in our single-cell pipeline. Additional updates in this release include streamlined CNV calling and methylation pipelines, gene fusion detection in repetitive regions, and increased ease of use of DRAGEN ORA (FASTQ compression).


  • BaseSpace Sequence Hub:導入と解析の概要

    録画ウェビナー(2020年5月) | イルミナテクニカルサポートでは、イルミナのクラウドベースのシーケンスデータ解析ソリューションであるBaseSpaceについてご紹介します。このプレゼンテーションでは、BaseSpaceダッシュボードの操作方法、一般的なBaseSpaceの機能、アプリケーションとワークフローの活用を成功させるためのヒントとコツについて説明します。次のトピックを取り上げます。BaseSpaceでデータをアップロード/表示する方法、主要な解析ワークフローのディスカッション、BaseSpaceでデータを分析する方法の一般的な概要。

    ご注意:BaseMountおよびBaseSpace CLIはアルファソフトウェアリリースです。機能と機能は時間の経過とともに変化する可能性があり、サポートはイルミナのソフトウェア開発から直接行われます。


  • Illumina DRAGEN Bio-IT Platform: What is new with version 3.9 updates

    Recorded Webinar (August 2021) | Tune in to our upcoming webinar to learn about the latest DRAGEN features and enhancements with the v3.9 release.  Significant highlights include the availability of DRAGEN on Microsoft Azure, RNA variant calling, Homologous Recombination Deficiency (HRD) for WGS data, graph genome accuracy improvements (most notably in the MHC region), and expanded capabilities in our single-cell pipeline. Additional updates in this release include streamlined CNV calling and methylation pipelines, gene fusion detection in repetitive regions, and increased ease of use of DRAGEN ORA (FASTQ compression).


  • NextSeq 1000/2000:DRAGEN解析の紹介

    録画ウェビナー(2021年8月) |  イルミナのテクニカルサポートが、新しいNextSeq 1000/2000プラットフォームでDRAGENを使用してデータ解析を実行する方法についてのディスカッションにご参加いただけます。このウェビナーは、NextSeq 1000/2000およびクラウドでのDRAGENの使用について、お客様に知っていただくことを目的としています。このウェビナーでは、クラウドでの装置ランのセットアップ、ハイブリッドモードとクラウドモードの解析、DRAGEN解析パイプライン、ヒントとベストプラクティスについて説明します。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:インストールの準備

    このコースでは、DRAGENサーバーのインストールプロセスの概要、セルフインストールに必要なリソースのリスト、配置、セキュリティ、ネットワークに関する考慮事項について説明します。

    10分


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:テクノロジーの概要

    このコースでは、シーケンスデータの二次解析にDRAGENプラットフォームを使用する利点を説明し、テクノロジーの概要を説明し、利用可能なパイプラインをリストアップします。

    言語 日本語

    10分


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.10アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2022年3月) | 最新のDRAGEN リリース – DRAGEN v3.10の詳細 このリリースでは、DRAGEN GraphとIllumina Machine Learningによる生殖細胞系列の小さなバリアントの精度の大幅な改善、RNA Ampliconサポートによる包括性の強化、ターゲットGBAコーラー、MHCグラフリファレンスの改善、集団ゲノミクスのスケーラビリティの改善など、エキサイティングな新しい進歩がもたらされます。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.5アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2020年2月) | DRAGENチームは、DRAGENバージョン3.5のリリースを発表します。このバージョンには、以前のバージョンと比較して、体細胞、SVおよびRNAパイプラインの精度が向上し、RNAパイプラインがさらに加速し、体細胞サンプルに対するCNV解析のサポート、マッピング速度を向上させるV8バージョンのマッパー、従来のGVCFの組み合わせ操作と比較して大規模コホートコールの新しいワークフロー、および高速ランダムおよび非ランダムなUMIリードの折りたたみのサポートが含まれます。 このウェビナーは、DRAGENの全ユーザーを対象としています。これらの機能は、オンサイトの顧客だけでなく、BaseSpaceやAWS Marketplaceなどのさまざまなプラットフォームのクラウドユーザーも利用できるようになります。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.6アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2020年6月) | DRAGENチームは、DRAGENバージョン3.6のリリースを発表します。このバージョンでは、DRAGEN FPGAにdeBrujinグラフ構造を実装することで、生殖細胞系列および体細胞バリアントコールパイプラインのランタイムを大幅に改善しています。また、FASTQC統計の生成、ポリGトリミング、JointGenotypingおよびCNVパイプラインの改善のサポートも発表いたします。このウェビナーは、DRAGENの新機能についてより詳しくお知りになりたいすべてのお客様を対象としています。これらの機能は、オンサイトの顧客だけでなく、BaseSpaceやAWS Marketplaceなどのさまざまなプラットフォームのクラウドユーザーも利用できるようになります。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.7アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2020年11月) | DRAGENチームは、DRAGENバージョン3.7のリリースを発表します。いつものように、これはいくつかの新機能と精度の向上を含むメジャーリリースです。シングルセルRNAパイプラインの初版をリリースできることを最も嬉しく思います。また、DRAGENチームが行った改善により、Precision FDA v2チャレンジで勝利を収めることができました。さらに、特にUMIベースのサンプル用のSNVコーラーの導入など、UMIを使用してエンドツーエンドのワークフローをユーザーに提供できます。新機能により、SVとCNVのコール精度をさらに向上させました。全ゲノム体細胞サンプルでは、すべてのバリアントコーラーとより統合されたワークフローを実行できるようになりました。また、当社のPop Gen Cohortコールイニシアチブについて、さらなる改善点を共有したいと思います。メチル化パイプラインに追加された新機能は、そのパイプラインを運用するユーザーにとって非常に価値があると考えています。これまでと同様に、これらのアップデートは、当社のさまざまなプラットフォームのオンサイトユーザーとクラウドユーザーが利用できるようになります。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.8アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2021年3月) | プリンシパルエンジニアのShyamal Mehtaliaが最近リリースしたv3.8で、最新のDRAGEN機能と改善点について学びます。主な特長は、FASTQファイルの迅速かつロスレスな圧縮を可能にするDRAGEN ORA圧縮テクノロジーの導入であり、ストレージコストを最大80%削減します。また、TMBとMSIの導入とHLAタイピングにより、ターゲットコーラーとバイオマーカー機能も拡大します。 その他の機能や改善点には、ハードウェアアクセラレーションの一般化、グラフゲノム機能の拡大、スピードと精度の向上などがあります。BaseSpace Sequence Hubのユーザーは、DRAGEN DNA AmpliconとDRAGEN Single Cell RNA Appsの導入に期待しています。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:バージョン3.9アップデートの新機能

    録画ウェビナー(2021年8月) | v3.9リリースの最新のDRAGEN機能と機能強化について学びます。 Microsoft AzureでのDRAGENの可用性、RNAバリアントコール、WGSデータのための相同組み換え欠損(HRD)、グラフゲノム精度の向上(特にMHC領域)、および当社のシングルセルパイプラインにおける機能拡張など、重要な点があります。このリリースでは、CNVコールとメチル化パイプラインの合理化、反復領域での遺伝子融合の検出、DRAGEN ORA(FASTQ圧縮)の使いやすさの向上などの更新も追加されています。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:次世代データの超高速解析

    録画ウェビナー(2019年11月) | イルミナのDRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)Bio-ITプラットフォームは、フィールドプログラマブルゲートアレイ(FPGA)ハードウェアを効率的に作成されたソフトウェアと組み合わせて利用し、従来のCPUベースの手法で必要な時間のうちに、次世代シーケンス(NGS)データの高精度な解析を提供します。DRAGENプラットフォームはコスト効率の高い解析ソリューションで、小規模なシーケンスデータセットと非常に大規模なシーケンスデータセットの解析の間で簡単に拡張できます。このウェビナーは、DRAGEのユーザーを対象としていますLinuxコマンドラインに関する実用的な知識を持つ非サイトサーバーのユーザーを対象としています。このウェビナーでは、以下のトピックについて説明します。リファレンスハッシュテーブルの構築と利用可能なさまざまな高度なオプション、DRAGENオンサイトサーバーによるデータ入出力の推奨ベストプラクティス、生殖細胞系列パイプラインで利用可能なさまざまなタイプのバリアントコールの説明、および高度なオプションによる生殖細胞系列バリアントコールのデモンストレーション。


  • イルミナDRAGEN Bio-ITプラットフォーム:解析パイプラインの概要

    このコースでは、DRAGEN解析パイプラインの概要について説明します。このコースを修了すると、二次データ解析におけるDRAGENプラットフォームの役割を特定し、利用可能なパイプラインをリストアップし、期待される性能と精度を簡単に説明できるようになります。

    10分


  • メタゲノミクスパートII:解析の紹介

    録画ウェビナー(2021年3月) | メタゲノミクスシーケンスパートIの後、このウェビナーでは、メタゲノミクスにおけるデータ解析の紹介について説明します。イルミナのシーケンス技術に関する基本的な理解と、メタゲノミクスのライブラリー調製ワークフローに関する知識を前提としています。次のトピックについて話し合います:ターゲットメタゲノミクスとショットガンメタゲノミクス の概要、メタゲノミクスデータ解析 のオプション: BaseSpace Sequence Hub上の16sメタゲノミクスアプリとDRAGENメタゲノミクスパイプライン、BaseSpace Sequence Hub上のDRAGEN RNA病原体検出アプリ の概要。