MiSeqトレーニング

  • 導入トピック

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  • Bcl2Fastq v2+:はじめに

    Recorded Webinar(2019年4月) | Bcl2FastqはLinuxベースのソフトウェアで、イルミナのシーケンスランで生成されたベースコールファイルをFASTQファイルやデマルチプレックスサンプルに変換します。このウェビナーでは、Bcl2fastq v2+に焦点を当て、このコマンドラインプログラムが許可する設定可能なオプションに関心のある新規から中間ユーザーを対象としています。次のトピックを取り上げます:Bcl2Fastqの実行要件、コマンドラインの基本、よく使用されるオプション、よく聞かれる‘How To....’ 質問です。


  • MiSeq:インストールの準備

    このコースを修了すると、MiSeqの使用に必要なラボ環境について説明し、MiSeqの主要コンポーネントをリストアップし、MiSeqのネットワーク上の考慮事項を特定し、MiSeqの実行とメンテナンスに必要なユーザーが用意する消耗品をリストアップできるようになります。

    言語 中国語(簡体字)ドイツ語、日本語、韓国語、スペイン語

    20分


  • Sequencing Analysis Viewer(SAV) 初心者向けガイド

    Recorded Webinar(2020年12月) | Sequencing Analysis Viewer(SAV)ソフトウェアは、シーケンスラン中に生成された重要な品質メトリクスをユーザーが表示できるアプリケーションです。このウェビナーでは、SAVの使用方法や、シーケンスランの最も有用な情報を確認するためのヒントやコツについて、初心者向けのガイド付きツアーを提供します。このウェビナーは新規ユーザーを対象としており、SAVへのデータのロード方法、ソフトウェアの各タブで利用可能なメトリクス、ランレビューに最も価値のあるメトリクスとそれらを見つける場所の理解などのトピックを取り上げています。


  • イルミナの装置を受け取るまでの準備

    この動画では、イルミナのフィールドアプリケーションサイエンティストが、設置前、出荷、配送の段階で行っていただきたいことについて説明します。それぞれのプロセスで重要なステップを重点的にご説明し、ご利用いただける資料などを紹介します。地域によっては、このビデオに示されているステップがiSeq 100システムに適用されない場合があります。

    7分


  • シーケンス:基礎

    このコースを修了すると、DNA、RNA、セントラルドッグマについて説明し、従来のシーケンス手法について話し合い、従来のシーケンスと合成によるシーケンスを比較できるようになります。

    言語 フランス語、イタリア語、ドイツ語、スペイン語中国語(簡体字)

    15分


  • シーケンス:合成によるシーケンスの紹介(SBS)

    録画ウェビナー(2021年1月) | イルミナの次世代シーケンステクノロジーにより、大規模な並列シーケンスが可能になります。イルミナテクニカルサポートでは、サンプル調製、クラスター形成、合成化学によるシーケンスに関するプレゼンテーションとディスカッションにご参加いただけます。このウェビナーは、次世代シーケンサーの新人を対象としており、以下のトピックについて議論します。イルミナのライブラリー構築、プラットフォームによるクラスター形成法、合成によるシーケンス、マルチプレックスおよび一次解析。


  • シーケンス:イルミナテクノロジー

    このコースでは、核酸の抽出からシーケンスランの完了までのイルミナシーケンスワークフローの概要を説明します。

    言語 フランス語、イタリア語、ドイツ語、スペイン語中国語(簡体字)

    15分


  • ライブラリー調製

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  • AmpliSeq for Illumina:ライブラリー調製プロトコール

    このコースでは、AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製プロトコールに必要な項目を特定し、マルチプレックスアンプリコンランのプールプランニングリソースを紹介し、ライブラリー調製プロトコールの手順を示し、プロトコールのベストプラクティスをリストアップします。

    30分


  • AmpliSeq for Illumina:概要

    このコースでは、AmpliSeq for Illuminaアッセイテクノロジーについて説明し、3種類のパネルをリストアップし、アンプリコンシーケンスワークフローのステップを紹介し、アンプリコンシーケンスデータの解析オプションをリストアップします。

    15分


  • アンプリコンシーケンス:はじめに

    録画ウェビナー(2021年5月)| イルミナテクニカルサポートが、アンプリコンシーケンスプロジェクトのエンドツーエンドのワークフローについてお話しします。このウェビナーは、イルミナ次世代シーケンスの新規ユーザーに最適です。アンプリコンライブラリーの定義、アンプリコンライブラリーのキットとプロトコール、アンプリコンシーケンスランとパラメーターなど、アンプリコンシーケンスについてお話しします。


  • イルミナDNA調製ライブラリー調製

    このコースを修了すると、イルミナDNA Prepキットの識別、プロトコールの仕組みの説明、プロトコールの完了に必要なものの特定、ライブラリー調製ワークフローのさまざまなステップの定義ができるようになります。

    20分


  • イルミナ実験マネージャー

    このコースでは、イルミナのExperiment Managerについて紹介し、サンプルプレートとサンプルシートを作成する手順を示します。

    25分


  • 装置およびソフトウェア

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  • Illumina Proactiveのメリット

    イルミナプロアクティブによる装置性能モニタリングの利点について学びます。イルミナプロアクティブは、装置性能データをイルミナに送信して予防的なメンテナンスを可能にするサービスです。

    10分


  • Local Run Manager v2

    このコースでは、Local Run Manager v2ソフトウェアを使用してシーケンスランを設定し、解析結果を表示する方法を説明します。 Local Run Manager v2は、MiniSeq Control Software v2以降を使用するMiniSeq装置、NextSeq Control Software v4以降を使用するNextSeq 500/550装置、MiSeq Control Software v3を使用するMiSeq装置で利用できます。

    言語 フランス語、イタリア語、ドイツ語、スペイン語、 中国語(簡体字)

    20分


  • Local Run Manager v3

    このコースでは、Local Run Manager v3ソフトウェアを使用してシーケンスランを設定し、解析結果を表示する方法を説明します。 Local Run Manager v3は、MiSeq Control Software v4以降を使用するMiSeq装置で利用できます。

    言語 中国語(簡体字)ドイツ語、日本語、韓国語、スペイン語

    20分


  • Local Run Manager v3 with MiSeq Control Software v4:はじめに

    録画ウェビナー(2021年2月) | MiSeq Windows 10のアップデートとMiSeq Control Softwareバージョン4で 起動するLocal Run Managerバージョン3は、ラン管理とデータ解析のためのWindowsベースのソフトウェアソリューションです。Local Run Manager v3はMiSeq Reporterに代わるもので、このウェビナーではLocal Run Manager v3の機能を紹介します。Local Run Manager v3の機能、ランのセットアップとデータ解析の方法、利用可能な解析ワークフロー、MiSeq Control Software V4との相互作用について取り上げます


  • MiSeq: Introduction to the MiSeq System

    After completing this course, you will be able to describe the simplified sequencing workflow on the MiSeq, understand the features of MiSeq, and list the six MiSeq sequencing workflows.

    Languages: Spanish, Chinese (Simplified), Japanese

    20 min


  • MiSeq:インストールの準備

    このコースを修了すると、MiSeqの使用に必要なラボ環境について説明し、MiSeqの主要コンポーネントをリストアップし、MiSeqのネットワーク上の考慮事項を特定し、MiSeqの実行とメンテナンスに必要なユーザーが用意する消耗品をリストアップできるようになります。

    言語 中国語(簡体字)ドイツ語、日本語、韓国語、スペイン語

    20分


  • MiSeq:ランの品質とベストプラクティス

    録画ウェビナー(2021年10月) |  イルミナテクニカルサポートはMiSeqシステムディスカッションにユーザーを招待します。MiSeqシステムは、クラスター形成、増幅、シーケンス、およびデータ解析を1つの装置に統合します。このウェビナーでは、これらの各ステップでトラブルシューティングに関する検討事項を説明し、イルミナのシーケンスワークフローとSequence Analysis Viewer(SAV)ソフトウェアの基本を理解している新規および中間ユーザーを対象としています。ランのセットアップと開始のベストプラクティス、SAVを使用したランの進捗状況の評価、ヒントとベストプラクティスについて取り上げます


  • MiSeq:ランの開始方法

    このコースを修了すると、MiSeqランセットアップオプションを特定し、MiSeq試薬カートリッジとロードライブラリーの準備方法について説明し、MiSeq Control Software(MCS)でシーケンスランを開始するステップをリストアップできるようになります。

    言語 中国語(簡体字)ドイツ語、日本語、韓国語、スペイン語

    20分


  • MiSeq:ランは成功しましたか?

    このコースを修了すると、MiSeqランをモニタリングするための2つのオプションをリストアップし、MiSeq Control Software(MCS)で主要なメトリクスを記述し、Sequencing Analysis Viewer(SAV)で主要なメトリクスを記述できるようになります。

    言語 中国語(簡体字)ドイツ語、日本語、韓国語、スペイン語

    20分


  • イルミナプロアクティブを実装するためのIT要件

    このビデオでは、イルミナが提供する機器性能モニタリングサービスであるイルミナプロアクティブを実装するためのIT要件について説明します。これにより、機器の稼働時間の増加、運用効率の向上、リソースの損失リスクの低減が実現します。

    4分


  • パターン化されていないフローセルにおける最適ではないクラスター形成の診断

    パターン化されていないフローセルのクラスター化を診断するために、ラン中にモニタリングするランメトリクスとサムネイル画像について学びます。

    8分


  • メタゲノミクスパートII:解析の紹介

    録画ウェビナー(2021年3月) | メタゲノミクスシーケンスパートIの後、このウェビナーでは、メタゲノミクスにおけるデータ解析の紹介について説明します。イルミナのシーケンス技術に関する基本的な理解と、メタゲノミクスのライブラリー調製ワークフローに関する知識を前提としています。次のトピックについて話し合います:ターゲットメタゲノミクスとショットガンメタゲノミクス の概要、メタゲノミクスデータ解析 のオプション: BaseSpace Sequence Hub上の16sメタゲノミクスアプリとDRAGENメタゲノミクスパイプライン、BaseSpace Sequence Hub上のDRAGEN RNA病原体検出アプリ の概要。


  • 最適なクラスター密度のベストプラクティス

    このビデオでは、最適なクラスター密度と、過剰および過少クラスターがシーケンスデータにどのように影響するかについて説明します。また、一般的なクラスター化の問題とその防止方法についても調べます。

    10分


  • データ解析

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  • BaseSpace Sequence Hub:導入と解析の概要

    録画ウェビナー(2020年5月) | イルミナテクニカルサポートでは、イルミナのクラウドベースのシーケンスデータ解析ソリューションであるBaseSpaceについてご紹介します。このプレゼンテーションでは、BaseSpaceダッシュボードの操作方法、一般的なBaseSpaceの機能、アプリケーションとワークフローの活用を成功させるためのヒントとコツについて説明します。次のトピックを取り上げます。BaseSpaceでデータをアップロード/表示する方法、主要な解析ワークフローのディスカッション、BaseSpaceでデータを分析する方法の一般的な概要。

    ご注意:BaseMountおよびBaseSpace CLIはアルファソフトウェアリリースです。機能と機能は時間の経過とともに変化する可能性があり、サポートはイルミナのソフトウェア開発から直接行われます。


  • Local Run Manager v2(研究用のみ):はじめに - 装置内および装置外

    Recorded Webinar(2021年1月) | Local Run Managerは、ローカル解析オプションとランおよびユーザー管理を含むイルミナのベンチトップシーケンスデータ用のWindowsベースのソフトウェアです。装置外バージョンや装置制御ソフトウェアにバンドルされたバージョンなど、Local Run Manager v2のResearch Use Only(RUO)バージョンの概要を提供します。このウェビナーでは、Dxバージョンのソフトウェアは扱いません。Local Run Manager v2の機能、利用可能なバージョンと解析オプション、ランのセットアップとデータ解析の方法、装置上の制御ソフトウェアとの相互作用、その他のイルミナ解析ソフトウェアとの比較について取り上げます。


  • Local Run Manager v3 with MiSeq Control Software v4:はじめに

    録画ウェビナー(2021年2月) | MiSeq Windows 10のアップデートとMiSeq Control Softwareバージョン4で 起動するLocal Run Managerバージョン3は、ラン管理とデータ解析のためのWindowsベースのソフトウェアソリューションです。Local Run Manager v3はMiSeq Reporterに代わるもので、このウェビナーではLocal Run Manager v3の機能を紹介します。Local Run Manager v3の機能、ランのセットアップとデータ解析の方法、利用可能な解析ワークフロー、MiSeq Control Software V4との相互作用について取り上げます


  • MiSeq: Data Analysis Overview

    After completing this course you will be able to list the MiSeq data analysis tools, briefly describe the function of each tool, and list some considerations when choosing your MiSeq data analysis tool.

    Languages: SpanishJapanese

    10 min


  • MiSeq:MiSeq Reporter

    このコースを修了すると、MiSeq Reporterのすべてのワークフローに共通するデマルチプレックスおよびアライメントプロセスとプログラムインターフェースを理解できるようになります。また、サポートされているMiSeq Reporterワークフローの有用性についても簡単に説明することができます。 MiSeq Reporterは、MiSeq Control Software v2.6以前を使用する装置で利用できます。

    25分


  • MiSeq:イメージングとベースコーリング

    このコースを修了すると、MiSeqがどのように画像を処理して強度を抽出し、強度を処理してベースコールを抽出するかを理解できるようになります。 これらのプロセスはMiSeqによって自動的に完了されます。

    35分


  • インサートを通してシーケンスしたかどうかはどのようにしてわかりますか? パート1

    イルミナのフィールドアプリケーションサイエンティストが、調製済みライブラリーのインサートを通してシーケンスを行う意味を説明します。ライブラリーのインサートサイズの範囲を評価するために、バイオアナライザーのトレースを調べます。

    7分


  • インサートを通してシーケンスしたかどうかはどのようにしてわかりますか? パート2

    このビデオでは、Sequencing Analysis Viewer(SAV)プロットを使用してシーケンスインサートが短すぎるかどうかを判断する方法を説明します。また、MiSeqのアダプターtrimming.txtファイルを使用してショートインサートを診断する方法も検討します。

    5分


  • パターン化されていないフローセルにおける最適ではないクラスター形成の診断

    パターン化されていないフローセルのクラスター化を診断するために、ラン中にモニタリングするランメトリクスとサムネイル画像について学びます。

    8分


  • マイHiSeqまたはMiSeqランはオーバークラスター化されていますか?

    このビデオでは、オーバークラスターの概要と、それがシーケンスデータにどのように影響するかについて説明します。イルミナのフィールドアプリケーションサイエンティストが、Sequencing Analysis Viewer(SAV)を使用して、過剰クラスター化されたHiSeqまたはMiSeqフローセルの一般的な症状を探す方法を紹介します。

    7分