ライブラリーを調製する前に、NextSeq 550システムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelは、1回のアッセイで20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを測定するための高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスアッセイです。
| プール数 | 濃度 | アンプリコン数 | 平均アンプリコン長（bp） | 平均ライブラリー長（bp） |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2.5倍 | 20,802 | 104 | 244 |
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelを完成するには、パネルと以下のライブラリー調製、cDNA合成、インデックスキット が必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。
各RNAサンプルについて、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelは1つのRNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。
| サンプル数 | 24サンプル | 96サンプル | 384サンプル |
|---|---|---|---|
| ライブラリー数 | 24ライブラリー | 96ライブラリー | 384ライブラリー |
| AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット1個 | 96反応キット1個 | 1 384反応キット |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 1 | 4 |
| cDNA合成 | 1 | 1 | 2 |
以下のシステムと試薬キットを使用した、Sequence AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelライブラリー。
| システム | 試薬キット | ラン当たりのサンプル数 |
|---|---|---|
| MiniSeqシステム | MiniSeq High Output Reagent Kit | 3 |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Kit v3 | 3 |
| NextSeqシステム | NextSeq Mid Output v2キット | 12 |
| NextSeq High Output v2キット | 40 |