AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2対応製品

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。

ライブラリー調製

パネルの説明

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer(COSMIC)データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。 

プール数 濃度 アンプリコン数 平均アンプリコン長(bp) 平均ライブラリー長(bp)
1 5X 207 106 246
ライブラリー調製およびインデックスキット

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2プロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製およびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24、96、384反応構成で利用できます。

サンプル数

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、各DNAサンプルに対して1つのDNAライブラリー を生成します。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。

適切な数のサンプルを調製するには、以下のキット数と組み合わせが必要です。

サンプル数 24サンプル 96サンプル 384サンプル
ライブラリー数 24ライブラリー 96ライブラリー 384ライブラリー
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 1 4 16
AmpliSeq Library PLUS for Illumina 24反応キット1個 96反応キット1個 1 384反応キット
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) 1 1 4
cDNA合成 該当なし 該当なし 該当なし

シーケンスガイドライン

以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2ライブラリーをシーケンスします。

システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 32
  MiniSeq High Output Reagent Kit 96
MiSeq システム MiSeq Reagent Nano Kit v2 4
  MiSeq Reagent Micro Kit v2 16
  MiSeq Reagent Kit v2 60
  MiSeq Reagent Kit v3 96