AmpliSeq for Illumina Focus Panel対応製品

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。

ライブラリー調製

パネルの説明

AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形腫瘍との関連性が知られている52の遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。

コンポーネント プール数 濃度 アンプリコン数 平均アンプリコン長(bp) 平均ライブラリー長(bp)
DNA 1 5X 269 107 247
RNA 1 5X 284 93 233
ライブラリー調製およびインデックスキット

AmpliSeq for Illumina Focus Panelプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製、cDNA合成、インデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。

サンプル数

AmpliSeq for Illumina Focusプロトコールは、サンプルごとに1つのDNAと1つのRNAライブラリーを生成します。 サンプルは、DNA、RNA、またはペアにすることができます。このプロトコールのサンプルはペアになります。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーは、シーケンスに必要な末端を持つ独自のDNAまたはRNA調製物です。

適切な数のサンプルを調製するには、以下のキット数と組み合わせが必要です。

サンプル数

24サンプル

96サンプル 384サンプル
ライブラリー数 48ライブラリー
(24 DNA、24 RNA)
192ライブラリー
(96 DNA、96 RNA)
768ライブラリー
(384 DNA、384 RNA)
AmpliSeq for Illumina Focus Panel 1 4 16
AmpliSeq Library PLUS for Illumina 24反応キット2個 96反応キット2個 2 384反応キット
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) 1 2 8
cDNA合成 1 1 4

シーケンスガイドライン

以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina Focus Panelライブラリーをシーケンスします。

DNAサンプル
システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 24
  MiniSeq High Output Reagent Kit 72
MiSeq システム MiSeq Reagent Micro Kit v2 12
  MiSeq Reagent Kit v2 40
  MiSeq Reagent Kit v3 72
RNAサンプル
システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 48
MiSeq システム MiSeq Reagent Kit v2 96
  MiSeq Reagent Nano Kit v2 6
  MiSeq Reagent Micro Kit v2 24
DNAサンプルとRNAサンプルの組み合わせ
システム 試薬キット ランごとのDNAサンプル ランごとのRNAサンプル ランあたりのサンプルの組み合わせ
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 16 16 32
  MiniSeq High Output Reagent Kit 48 48 96
MiSeq システム MiSeq Reagent Micro Kit v2 8 8 16
  MiSeq Reagent Kit v2 30 30 60
  MiSeq Reagent Kit v3 48 48 96