ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形腫瘍との関連性が知られている52の遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。
| コンポーネント | プール数 | 濃度 | アンプリコン数 | 平均アンプリコン長（bp） | 平均ライブラリー長（bp） |
| DNA | 1 | 5X | 269 | 107 | 247 |
| RNA | 1 | 5X | 284 | 93 | 233 |
AmpliSeq for Illumina Focus Panelプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製、cDNA合成、インデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。
AmpliSeq for Illumina Focusプロトコールは、サンプルごとに1つのDNAと1つのRNAライブラリーを生成します。 サンプルは、DNA、RNA、またはペアにすることができます。このプロトコールのサンプルはペアになります。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーは、シーケンスに必要な末端を持つ独自のDNAまたはRNA調製物です。
適切な数のサンプルを調製するには、以下のキット数と組み合わせが必要です。
サンプル数 |
24サンプル |
96サンプル | 384サンプル |
| ライブラリー数 | 48ライブラリー （24 DNA、24 RNA） |
192ライブラリー （96 DNA、96 RNA） |
768ライブラリー （384 DNA、384 RNA） |
| AmpliSeq for Illumina Focus Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット2個 | 96反応キット2個 | 2 384反応キット |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 2 | 8 |
| cDNA合成 | 1 | 1 | 4 |
以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina Focus Panelライブラリーをシーケンスします。
| システム | 試薬キット | ラン当たりのサンプル数 |
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 24 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 72 | |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 12 |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 40 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 72 |
| システム | 試薬キット | ラン当たりのサンプル数 |
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 48 |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Kit v2 | 96 |
| MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 6 | |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 24 |
| システム | 試薬キット | ランごとのDNAサンプル | ランごとのRNAサンプル | ランあたりのサンプルの組み合わせ |
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 16 | 16 | 32 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 48 | 48 | 96 | |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 8 | 8 | 16 |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 30 | 30 | 60 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 48 | 48 | 96 |