ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR Beta Panelは、T細胞受容体(TCR)ベータ鎖の再構成をシーケンスすることにより、T細胞多様性とクローン増殖を測定するための高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスパネルです。
パネル | プール数 | 濃度 |
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel | 1 | 5X |
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoireプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoireは、RNAサンプルごとに1つのRNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。
サンプル数 |
24サンプル |
96サンプル | 384サンプル |
ライブラリー数 | 24ライブラリー | 96ライブラリー | 384ライブラリー |
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel | 1 | 4 | 16 |
AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット1個 | 96反応キット1個 | 1 384反応キット |
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) | 1 | 1 | 4 |
cDNA合成 | 1 | 1 | 4 |
以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panelライブラリーをシーケンスします。
システム | 試薬キット |
MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit |
MiniSeq High Output Reagent Kit | |
MiSeq システム | MiSeq Reagent Kit v3 |
NextSeqシステム | NextSeq Mid Output v2キット |
NextSeq High Output v2キット |