Illumina DNA Prep with Enrichment Compatible Products

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。

ライブラリー調製

インデックスキット

Illumina DNA Prep with Enrichmentは、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexesと互換性があります

FFPEインプット

抽出したFFPEからプロトコールを開始するには、FFPEの適格性確認にInfinium FFPE QC Kitを使用します。手順については、Infinium FFPE QCアッセイインサートを参照してください

シーケンスガイドライン

IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes

イルミナは、使用するエンリッチメントプローブパネルに関係なく、1リードあたり101サイクル(2 x101)およびインデックスリードあたり10サイクルのペアエンドランを設定することを推奨します。追加のオーバーラップリードまたはローカバレッジが必要な場合は、最大2 x 126または2 x 151のシーケンスが可能ですが、必須ではありません。

追加のオーバーラップリードまたはローカバレッジのために2x151シーケンスランを設定する場合は、以下の表を参照してください。

MiniSeqおよびNextSeq 500/550システムでは、試薬カートライドRFIDは最大サイクル数をエンコードします。300サイクルキットの最大値では、各インデックスリードに10サイクルが必要な場合、リード1とリード2のリード長は完全には許容されません。したがって、フルリード長のシーケンスでは、リード1とリード2からそれぞれ2サイクルを減算する必要があります。

シーケンスシステム リード1 インデックス1 インデックス2 リード2

iSeq 100、MiSeq(v2/v3)、HiSeq 2500/3000/4000、NovaSeq 6000

151

10

10

151

MiniSeq、NextSeq 500/550

149

10

10

149