NextSeq Control Software（NCS）v4へのアップグレードの一環として、NextSeqシステムはシーケンスランを管理するための統合ソフトウェアソリューションであるLocal Run Managerを受け取ります。Local Run Managerは装置制御ソフトウェアと統合し、NextSeqシステム上で直接アクセスすることも、リモートで実行することもできます。
Local Run Managerは、サンプル、ラン、および解析のセットアップ、および解析結果の表示のための合理化された使いやすいインターフェースを実現します。また、サンプルシートのインポートとエクスポートもサポートしています。ユーザー管理には、権限設定と監査証跡が含まれます。Local Run Managerでは、さまざまなライブラリータイプを解析するための複数の解析モジュールを利用できます。
Local Run Managerは装置ソフトウェアスイートの一部であり、別途インストールする必要はありません。
装置がインターネットに接続されている場合は、モジュールファイルをダウンロードしてLocal Run Managerシステムに直接インストールできます。解析モジュールは、イルミナサポートウェブサイトのLocal Run Managerソフトウェアのダウンロードページから個別にダウンロードします。
Local Run Managerは以下の解析モジュールをサポートしています。* 各モジュールのリファレンスガイドでは、モジュールの基礎となる解析パイプラインについて説明します。
* さらに、さまざまなサードパーティの解析ソリューションが利用可能で、それぞれに独自の機能と制限があります。最適なソリューションを決定するために、プロジェクトごとに潜在的なソリューションを評価することが推奨されます。
NCS v4へのアップグレードにより、プロジェクトをBaseSpace Sequence Hubにアップロードするには、PrepタブではなくLocal Run Managerでランを設定する必要があります。Prepタブを使用したBaseSpace Sequence Hubで生成されたデータとランセットアップのためのLocal Run Managerで生成されたデータは同等です。Local Run Managerを装置上で使用する場合、装置上での解析とクラウドベースの解析はモジュールによって異なる場合があるため、Prepタブで生成された以前のデータと出力を直接比較することをお勧めします。