シングルセルRNA解析パイプラインは、サードパーティキットとの互換性を提供します。このセクションには、各シングルセルRNAライブラリーキットと互換性のあるサードパーティキットに関する情報が記載されています。イルミナの商標に関する情報は、法的情報およびガイドラインを参照してください。
以下の画像は、シングルセルRNAライブラリーキットタイプ1~5の遺伝子構造を示しています。
Single Cell RNA Library Prep Kits 1~5は、以下の第三者キットと互換性があります。
シングルセルRNAライブラリーキットタイプ |
サードパーティーキット |
メーカー |
シングルセルRNAライブラリーキット1 |
Chromium Next GEM Single Cell 3' v3.1 |
10xゲノミクス |
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression (遺伝子発現のみ) |
10xゲノミクス | |
シングルセルRNAライブラリーキット2 |
Chromium Single Cell 3' v2 |
10xゲノミクス |
シングルセルRNAライブラリーキット3 |
Chromium Single Cell 5' v1 |
10xゲノミクス |
シングルセルRNAライブラリーキット4 |
Chromium Next GEM Single Cell 5' v2(デュアルインデックス) |
10xゲノミクス |
シングルセルRNAライブラリーキット5 | ドロップシーケンス | ドロマイト |
以下の画像は、Single Cell RNA Library Kit Type 6の遺伝子構造を示しています。Single Cell RNA Library Kit Type 6は、BD Rhapsody Targeted mRNAおよびAbSeq Amplification、BD Biosciencesと互換性があります。
シングルセルRNAライブラリー調製キットは、以下のインデックスキットと互換性があります。
シングルセルRNAライブラリーキットタイプ |
インデックスアダプター | インデックスキット | メーカー |
シングルセルRNAライブラリーキット1 |
シングルセルRNAインデックスアダプター1 | シングルインデックスキットTセットA | 10xゲノミクス |
シングルセルRNAインデックスアダプター1-B | デュアルインデックスキットTTセットA | 10xゲノミクス | |
シングルセルRNAライブラリーキット2 |
シングルセルRNAインデックスアダプター2 | Chromium i7マルチプレックスキット | 10xゲノミクス |
シングルセルRNAライブラリーキット3 |
シングルセルRNAインデックスアダプター3 | Chromium i7マルチプレックスキット | 10xゲノミクス |
シングルセルRNAライブラリーキット4 |
シングルセルRNAインデックスアダプター 4-A | デュアルインデックスキットTNセットA | 10xゲノミクス |
シングルセルRNAインデックスアダプター 4-B | デュアルインデックスキットTTセットA | 10xゲノミクス | |
シングルセルRNAライブラリーキット5 | シングルセルRNAインデックスアダプター5 | Nextera XTインデックス | イルミナ |
シングルセルRNAライブラリーキット6 | シングルセルRNAインデックスアダプター6 | ライブラリーリバースプライマー1-4 | BDバイオサイエンス |
以下の画像は、シングルセルATACライブラリーキット1の遺伝子構造を示しています。
以下の画像は、シングルセルATACライブラリーキット2の遺伝子構造を示しています
シングルセルATACライブラリーキット1~2は、以下のサードパーティキットと互換性があります。
シングルセルATACライブラリーキットタイプ |
サードパーティーキット |
メーカー |
シングルセルATACライブラリーキット1 |
Chromium Next GEMシングルセルATAC |
10xゲノミクス |
シングルセルATACライブラリーキット2 |
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression (ATACのみ) |
10xゲノミクス |
シングルセルATACライブラリー調製キットは、以下のインデックスキットと互換性があります。
シングルセルATACライブラリーキットタイプ |
インデックスアダプター | インデックスキット | メーカー |
シングルセルATACライブラリーキット1 |
シングルセルATACインデックスアダプター1 | シングルインデックスキットNセットA | 10xゲノミクス |
シングルセルATACライブラリーキット2 |
シングルセルATACインデックスアダプター2 | シングルインデックスキットNセットA | 10xゲノミクス |