Infinium HumanMethylation450K BeadChip製品内容とストレージ

イルミナ提供の消耗品
アイテム 数量 ストレージ

STM(すべてのSTMチューブが
ラベル上の同じ染色温度)

チューブ2本

-15°~-25°C

XC4

310  mL

-15°~-25°C

XC2

チューブ2本

-15°~-25°C

ATM

チューブ2本

-15°~-25°C

RA1

FFPEプロトコールを実施する場合は、サンプルウェルあたり30 μLを使用します。
それ以外の場合は、サンプルウェルあたり46 μLを使用します

-15°~-25°C

FMS

FFPEプロトコールを実施する場合は、96サンプルにつき1チューブを使用します。
それ以外の場合は、96サンプルごとに2本のチューブを使用します

-15°~-25°C

RPM

チューブ2本
(96 サンプルあたり)

-15°~-25°C

MSM

チューブ2本
(96 サンプルあたり)

-15°~-25°C

XC1

チューブ2本

-15°~-25°C

RA1

10  mL

-15°~-25°C

TEM

チューブ2本

-15°~-25°C

PM1

チューブ2本(96 サンプルあたり)

2°~8°C

PB2

チューブ2本

室温

Te-Flowフロースルーチャンバー(ブラックフレーム、
スペーサー、ガラスバックプレート、クランプ)

1(BeadChip1枚につき)

室温

マルチサンプルのBeadChipアライメントフィクスチャー

1(BeadChip8枚につき)

室温

Hybチャンバーインサート

8

室温

PB1

550 ml(最大8枚のBeadChip)

室温

洗浄容器

2(最大8枚のBeadChip)

室温

洗浄ラック

1(最大8 BeadChip)

室温

Alconoxパウダー洗浄剤

必要に応じて

室温

EtOH

必要に応じて

室温

MA1

チューブ2本
(96 サンプルあたり)

室温

XC3

75 mL

室温

ハイブリダイゼーションチャンバー

2

室温

ハイブリダイゼーションチャンバーガスケット

2

室温

PB1

310  mL

室温

BeadChip

8

2°~8°C

ユーザーが用意する消耗品
アイテム 数量 ストレージ

95%ホルムアミド/1 mM EDTA

15  mL

-15°~-25°C

バイサルファイト変換DNAサンプルを含むBCDプレート

1プレート

-15°~-25°C

Lambda DNA

手順を参照

2°~8°C

0.1N NaOH

15 mL(96 サンプルあたり)

2°~8°C

PicoGreen dsDNA定量試薬

手順を参照

2°~8°C

Zymo EZ DNA Methylation Kit(バイサルファイトコンバージョンを含む
試薬、希釈バッファー、脱スルホン化バッファー、溶出バッファー)

50 サンプルあたり1キット

200 サンプルあたり1キット

または

2プレートあたり1キット

室温

Fluotrac 200 96ウェルフラットボトムプレート

Std DNAプレートにつき1枚

サンプルDNA プレートにつき1枚

室温

ゲノムDNA(HDメチル化用)

手動プロセスにおける亜硫酸水素塩変換反応ごとに500  ng

自動プロセスにおける亜硫酸水素塩変換反応ごとに1000  ng

室温

EtOH

500 mL

室温

96ウェル0.2 mlスカート付きマイクロプレート

1~3プレート

室温

1X TE

手順を参照

室温

96ウェル0.8 mlマイクロタイタープレート(MIDI)

1プレート

室温

100% 2-プロパノール(イソプロパノール)

40 mL(96 サンプルあたり)

室温

96ウェル0.65 mLマイクロタイタープレート

96サンプルにつき1枚

室温