イルミナアレイ解析プラットフォーム製品ファイル

IAAP Genotyping Orchestrated Worfklowは、一連の生の強度データ、ビーズプールマニフェスト、クラスターファイルを入力として取得し、イルミナのGTCフォーマットやPEDファイルなどのさまざまなフォーマットでサンプルレベルの品質メトリクスとともに遺伝子型コールを報告する、完全にオーケストレーションされたワークフローです。アップストリームまたはダウンストリームのパイプラインとの統合を促進するために、一連の公開された安全なAPIを使用します。Genotyping Orchestrated Workflowは、さまざまなワーカーノードにわたるサンプルのオーケストレーションを管理でき、サンプルのスループットに合わせて計算能力を調整するためにスケールアップまたはスケールダウンできます。

IAAP Genotyping Command Line Interface（CLI）を使用すると、ジェノタイピングワークフローを既存の完全にオーケストレーションされたデータ解析パイプラインに統合できます。CLIは、IAAP Genotyping Orchestrated Workflowと同じコア機能を提供しますが、ワークフローを通じてサンプルを管理したり、Dockerに依存したりすることはありません。