NovaSeq X Plus対応製品
NovaSeq X Plus
互換性のある製品
サンプル情報
サンプルIDやプーリングに使用するインデックスアダプターなど、サンプルに関する情報を記録するには、以下のオプションから選択します。
- クラウドに接続されている場合は、BaseSpace Sequence HubでRun Planningを使用できます。
- ローカルネットワークに接続している場合は、リモートコントロールソフトウェアから入手できるサンプルシートv2テンプレートを使用できます。
- ローカルネットワークに接続されていない場合は、完了したランで生成されたサンプルシートを使用できます。
データ解析
Sequencing Analysis Viewer または BaseSpace Sequence Hub を使用して、ラン中のリアルタイムの品質メトリクスを監視します。
シーケンスデータを解析するには、以下のオプションから選択します。
NovaSeq X Plusシーケンスシステムは、装置上のイルミナDRAGEN BIO-ITプラットフォームサーバーを使用して二次解析を実行します。詳細については、NovaSeq X Plus製品マニュアルを参照してください。
リファレンスゲノム
装置上のリファレンスゲノム
| ゲノム名 | 表示名 | 種 | GTFが利用可能 |
|---|---|---|---|
| hg19_alt_masked+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [UCSC] hg19 Alt Masked v2 | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hg19_alt_masked_graph+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [UCSC] hg19 Alt Masked v2グラフ | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hs37d5+cnv+rna | Homo sapiens [NCBI] hs37d5 | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hs37d5_graph_based | Homo sapiens [NCBI] hs37d5グラフ | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hg38_alt_masked+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 Alt Masked v2 | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hg38_alt_masked_graph+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 Alt Masked v2グラフ | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| hg38-デコイ入りノルト | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 Alt Hapsなし | Homo sapiens [ヒト〕 | あり |
| A_タリアナ | A. thaliana [TAIR] TAIR10 | アラビドプシス タリアナ | なし |
| eschColi_K12_1 | 大腸菌［NCBI］K12 MG1655 | 大腸菌［株K12］ | なし |
| mm10 | ムスムスムス［UCSC］ mm10 | Mus Musculus [マウス〕 | あり |
| フィックス | マイクロウイルス大腸菌ウイルスphiX174 [NCBI]PhiX | PhiX | なし |
| rn6 | Rattus norvegicus [UCSC] rn6 | Rattus Norvegicus [ノルウェーのラット〕 | あり |
| Rhodobacter_sphaeroides_2.4.1_12905 | R.sphaeroides [NCBI] 2.4.1 | ロドバクタースファロイデス［細菌］ | なし |
| Bacillus_cereus_ATCC_10987 | B. cereus [NCBI] ATCC_10987 | セレウス菌［細菌］ | なし |
| WBcel235 | C. elegans [Ensembl] WBcel235 | Caenorhabditis Elegans [Roundworm] | なし |
| eschColi_K12_1 | E.コリ株K12 | 大腸菌［株K12］ | なし |