NovaSeq Xシリーズ対応製品
NovaSeq Xシリーズ
互換性のある製品
サンプル情報
サンプルIDやプーリングに使用するインデックスアダプターなど、サンプルに関する情報を記録するには、以下のオプションから選択します。
- クラウドに接続されている場合、ランを計画するには、BaseSpace Sequence Hubを使用できます。
- ローカルネットワークに接続している場合は、リモートコントロールソフトウェアから入手できるサンプルシートv2テンプレートを使用できます。
- ローカルネットワークに接続されていない場合は、完了したランで生成されたサンプルシートを使用できます。
データ解析
Sequencing Analysis Viewer または BaseSpace Sequence Hub を使用して、ラン中のリアルタイムの品質メトリクスを監視します。
シーケンスデータを解析するには、以下のオプションから選択します。
NovaSeq X Plusシーケンスシステムは、装置上のIllumina DRAGEN Bio-IT Platformを使用して二次解析を実行します。詳細については、NovaSeq X Plus製品ドキュメントを参照してください。
リファレンスゲノム
装置上のリファレンスゲノム
| ゲノム名 | 表示名 | 種 | GTF利用可能 |
|---|---|---|---|
| hg19_alt_masked+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [UCSC] hg19 Alt Masked v2 | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hg19_alt_masked_graph+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [UCSC] hg19 Alt Masked v2 Graph | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hs37d5+cnv+rna | Homo sapiens [NCBI] hs37d5 | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hs37d5_graph_based | Homo sapiens [NCBI] hs37d5 Graph | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hg38_alt_masked+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 Alt Masked v2 | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hg38_alt_masked_graph+cnv+hla+rna_v2 | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 Alt Masked v2 Graph | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| hg38-noalt-with-decoy | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 No Alt Haps | ホモサピエンス［ヒト］ | あり |
| シロイヌナズナ | シロイヌナズナ [TAIR] TAIR10 | シロイヌナズナ | なし |
| eschColi_K12_1 | E. coli [NCBI] K12 MG1655 | 大腸菌［K12株］ | なし |
| mm10 | ハツカネズミ [UCSC] mm10 | ハツカネズミ [マウス] | あり |
| phix | Microvirus Escherichia virus phiX174 [NCBI]PhiX | PhiX | なし |
| rn6 | ドブネズミ [UCSC] rn6 | ドブネズミ [ノルウェーのラット] | あり |
| Rhodobacter_sphaeroides_2.4.1_12905 | R.sphaeroides [NCBI] 2.4.1 | ロドバクター・スフェロイデス [細菌] | なし |
| Bacillus_cereus_ATCC_10987 | セレウス菌 [NCBI] ATCC_10987 | Bacillus Cereus [Bacterium] | なし |
| WBcel235 | C.エレガンス [Ensembl] WBcel235 | カエノラブディティス・エレガンス [線虫] | なし |
| eschColi_K12_1 | E.Coli Strain K12 | 大腸菌［K12株］ | なし |