ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina BRCA Panelは、BRCA BRCA1 BRCA2 遺伝子全体の体細胞および生殖細胞系列バリアントの研究のためのターゲットリシーケンスアッセイです。詳細な仕様については、AmpliSeq for Illumina BRCA Panelを参照してください。
| プール数 | 濃度 | アンプリコン数 | 平均アンプリコン長（bp） | 平均ライブラリー長（bp） |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 5X | 265 | 98 | 238 |
AmpliSeq for Illumina BRCAプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。
AmpliSeq for Illumina BRCA Panelは、DNAサンプルごとに1つのDNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。
| サンプル数 | 24サンプル | 96サンプル | 384サンプル |
|---|---|---|---|
| ライブラリー数 | 24ライブラリー | 96ライブラリー | 384ライブラリー |
| AmpliSeq for Illumina BRCA Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット1個 | 96反応キット1個 | 1 384反応キット |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 1 | 4 |
| cDNA合成 | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina BRCAライブラリーをシーケンスします。
| システム | 試薬キット | ランあたりのライブラリー数 |
|---|---|---|
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 32 |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 96 |
| システム | 試薬キット | ランあたりのライブラリー数 |
|---|---|---|
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 24 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 80 | |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 3 |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 12 | |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 48 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 80 |