AmpliSeq for Illumina BRCA Panel対応製品

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。

ライブラリー調製

パネルの説明

AmpliSeq for Illumina  BRCA Panelは、BRCA BRCA1  BRCA2 遺伝子全体の体細胞および生殖細胞系列バリアントの研究のためのターゲットリシーケンスアッセイです。詳細な仕様については、AmpliSeq for Illumina BRCA Panelを参照してください

プール数 濃度 アンプリコン数 平均アンプリコン長(bp) 平均ライブラリー長(bp)
1 5X 265 98 238
ライブラリー調製およびインデックスキット

AmpliSeq for Illumina BRCAプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。

サンプル数

AmpliSeq for Illumina BRCA Panelは、DNAサンプルごとに1つのDNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸の試料であり、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。

適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。

サンプル数 24サンプル 96サンプル 384サンプル
ライブラリー数 24ライブラリー 96ライブラリー 384ライブラリー
AmpliSeq for Illumina BRCA Panel 1 4 16
AmpliSeq Library PLUS for Illumina 24反応キット1個 96反応キット1個 1 384反応キット
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) 1 1 4
cDNA合成 該当なし 該当なし 該当なし

シーケンスガイドライン

以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina BRCAライブラリーをシーケンスします。

生殖細胞系列バリアント
システム 試薬キット ランあたりのライブラリー数
MiSeq システム MiSeq Reagent Nano Kit v2 32
  MiSeq Reagent Micro Kit v2 96
体細胞バリアント
システム 試薬キット ランあたりのライブラリー数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 24
  MiniSeq High Output Reagent Kit 80
MiSeq システム MiSeq Reagent Nano Kit v2 3
  MiSeq Reagent Micro Kit v2 12
  MiSeq Reagent Kit v2 48
  MiSeq Reagent Kit v3 80