ライブラリーを調製する前に、 NextSeq 550システムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina Exome Panelは、PCRのエクソームシーケンスのスピードとシンプルさをもたらし、研究者は1回のランで8つのエクソームをシーケンスし、生殖細胞系列バリアントを迅速に同定することができます。
| プール数 | アンプリコン数 | 平均アンプリコン長（bp） | 平均ライブラリー長（bp） |
|---|---|---|---|
| 12 | 293,908 | 205 | 345 |
AmpliSeq for Illumina Exome Panelプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製およびインデックスキットが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24、96、384反応構成で利用できます。AmpliSeq CD Indexes for Illuminaキットは、このパネルに必要な大容量構成で提供されています。
AmpliSeq for Illumina Exome Panelでは、DNAサンプルごとに1つのDNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。
| サンプル数 | 8サンプル | 32サンプル | 128サンプル |
|---|---|---|---|
| ライブラリー数 | 8ライブラリー | 32ライブラリー | 128ライブラリー |
| AmpliSeq for Illumina Exome Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット1個 | 96反応キット1個 | 1 384反応キット |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 1 | 2 |
| cDNA合成 | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
以下のシステムと試薬キットを使用して、AmpliSeq for Illumina Exome Panelライブラリーをシーケンスします。
| システム | 試薬キット | ラン当たりのサンプル数 |
|---|---|---|
| NextSeqシステム | NextSeq Mid Output v2キット | 2 |
| NextSeq High Output v2キット | 8 |