ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、腫瘍と免疫系の相互作用に関与する395遺伝子のがんバイオマーカーの発現を定量化するためのターゲットリシーケンスアッセイです。
| プール数 | 濃度 | アンプリコン数 | 平均アンプリコン長（bp） | 平均ライブラリー長（bp） |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 5X | 398 | 106 | 246 |
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel プロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、RNAサンプルごとに1つのRNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。
| サンプル数 | 24サンプル | 96サンプル | 384サンプル |
|---|---|---|---|
| ライブラリー数 | 24ライブラリー | 96ライブラリー | 384ライブラリー |
| AmpliSeq for Illumina 免疫応答パネル | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24反応キット1個 | 96反応キット1個 | 1 384反応キット |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 1 | 4 |
| cDNA合成 | 1 | 1 | 4 |
以下のシステムおよび試薬キットを使用した、Sequence AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelライブラリー：
| システム | 試薬キット | ラン当たりのサンプル数 |
|---|---|---|
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 8 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 24 | |
| MiSeq システム | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 4 |
| MiSeq試薬キットv2 | 16 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 24 | |
| NextSeqシステム | NextSeq Mid Output v2キット | 96 |