AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel対応製品

サンプル情報

ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。

ライブラリー調製

パネルの説明

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、腫瘍と免疫系の相互作用に関与する395遺伝子のがんバイオマーカーの発現を定量化するためのターゲットリシーケンスアッセイです。

プール数 濃度 アンプリコン数 平均アンプリコン長(bp) 平均ライブラリー長(bp)
1 5X 398 106 246
ライブラリー調製およびインデックスキット

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel プロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。

サンプル数

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、RNAサンプルごとに1つのRNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。

適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数とキットの組み合わせが必要です。AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kitは、24反応、96反応、384反応構成で利用できます。

サンプル数 24サンプル 96サンプル 384サンプル
ライブラリー数 24ライブラリー 96ライブラリー 384ライブラリー
AmpliSeq for Illumina 免疫応答パネル 1 4 16
AmpliSeq Library PLUS for Illumina 24反応キット1個 96反応キット1個 1 384反応キット
AmpliSeq CD Set A(96反応、96インデックス) 1 1 4
cDNA合成 1 1 4

シーケンスガイドライン

以下のシステムおよび試薬キットを使用した、Sequence AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelライブラリー:

システム 試薬キット ラン当たりのサンプル数
MiniSeqシステム MiniSeq Mid Output Reagent Kit 8
MiniSeq High Output Reagent Kit 24
MiSeq システム MiSeq Reagent Micro Kit v2 4
MiSeq試薬キットv2 16
MiSeq Reagent Kit v3 24
NextSeqシステム NextSeq Mid Output v2キット 96