ライブラリーを調製する前に、シーケンスシステムで使用できるオプションを使用してサンプルに関する情報を記録してください。
AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR Panelは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルなど、複数のサンプルタイプで使用するための高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスパネルです。
| コンポーネント | プール数 | 濃度 |
|---|---|---|
| DNAとRNA | 1 | 5X |
AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SRプロトコールを完了するには、パネルと以下のライブラリー調製キットおよびインデックスキットが必要です。
AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR Panelは、DNAサンプルとRNAサンプルごとに1つのDNAライブラリーと1つのRNAライブラリーを生成します。サンプルは1つのソースからの核酸のサンプルで、ライブラリーは調製後のサンプルからの核酸です。サンプルはDNA、RNA、またはペアの場合があります。ライブラリーにはシーケンスに必要な末端があります。
適切なサンプル数を調製するには、以下のキット数と組み合わせが必要です。
| サンプル数 | 24サンプル | 96サンプル | 384サンプル |
|---|---|---|---|
| ライブラリー数 | 24ライブラリー | 96ライブラリー | 384ライブラリー |
| AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR パネル | 1 | 5 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 1 24反応キット (20019101) | 1 96反応キット (20019102) | 1 384反応キット (20019103) |
| AmpliSeq CD Set A（96反応、96インデックス） | 1 | 1 | 4 |
| AmpliSeq UD Indexes for Illumina（24インデックス、24サンプル） | 1 | 4 | 16 |
| [RNA] cDNA合成 | 1 | 1 | 4 |
以下のシステムと試薬キットを使用して 、AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR Panelライブラリーをシーケンスします。
| システム | 試薬キット |
|---|---|
| MiniSeqシステム | MiniSeq Mid Output Reagent Kit |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | |
| NextSeqシステム | NextSeq Mid Output v2キット |
| NextSeq High Output v2キット |