BaseSpace対応製品

16Sメタゲノミクス 

16S Metagenomics Appは、16S rRNAターゲット化アムプリケーションリードの分類を行います。 

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Amplicon DS アプリ

2本鎖ターゲットリシーケンスアッセイ専用に設計されたAmplicon DS Appは、マニフェストファイルで指定されたリファレンスに対してリードをアライメントし、バリアント解析を実行します。

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BWAエンリッチメント アプリ

BWA Enrichment Appは、全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、マニフェストファイルで指定された関心領域のバリアント解析を実行します。

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BWA全ゲノムシーケンス アプリ

BWA Whole Genome Sequencing Appは、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスを対象としており、指定されたリファレンスに対してリードをアライメントし、バリアント解析を実行します。

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エンリッチメント アプリ

Enrichment App(旧称Isaac Enrichment)は、特定のターゲットシーケンスにエンリッチされたDNAを解析し、特定のリファレンスに対してリードをアライメントした後、マニフェストファイルで指定された関心領域のバリアント解析を実行します。

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Isaac全ゲノムシーケンス アプリ

Isaac Whole Genome Sequencing Appは、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスを対象としており、リードを指定されたリファレンスにアライメントし、バリアント解析を実行します。

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RNA Expressアプリ

RNA Expressアプリは、RNAシーケンスリードを特定の遺伝子にアライメントし、差次的発現を実行します。

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RNA-Seq Alignmentアプリ

RNA-Seq Alignmentアプリは、RNAシーケンスリードを特定のリファレンスに対してアライメントし、Cufflinks Assembly & DEアプリを使用してバリアント解析、遺伝子融合検出、および新規スクリプトアセンブリを実行します。 

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小型RNA アプリ

Small RNA Appは、汚染物質、成熟miRNA、低分子RNA、およびゲノムリファレンスのデータベースに対してリードをアライメントし、短いRNAシーケンスを豊富に測定します。

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ターゲットRNA アプリ

Targeted RNA Appは、マニフェストファイルで指定されたリードをアライメントし、サンプル間の遺伝子とアイソフォームの相対発現を定量化し、サンプル間の存在量を比較します。

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TopHatおよびCufflinks RNA-Seqアプリ

TopHat Alignment and Cufflinks Assemblyアプリは、RNAシーケンスリードを特定のリファレンスにアライメントし、バリアント解析を実行し、リファレンス遺伝子と転写産物の量を推定します。 

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TruSeq Ampliconアプリ

TruSeq Ampliconアプリは、マニフェストファイルで指定されたリファレンスに対してリードをアライメントし、バリアント解析を実行します。

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TruSeqロングリードアセンブリ

TruSeq Long Reads Assemblyアプリは、ロングリードシーケンス用のライブラリーを生成し、高品質の合成ロングリード断片を組み立てます。

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TruSeqフェージングアプリ

TruSeq Phasing Appは、全ヒトゲノムファシンを実行し、アリル特異的解析のためのハプロタイプ断片の生成を可能にします。 

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TruSight Tumor 15 アプリ

TruSight Tumor 15アプリは、マニフェストファイルで指定されたリードをアライメントし、がんに関連する一連のリファレンスパネル遺伝子の体細胞バリアントを報告します。

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腫瘍正常アプリ

Tumor Normalは、腫瘍サンプルと正常サンプルの組み合わせから体細胞バリアントを検出します。 

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TruSeq Nano DNA HT

TruSeq DNA PCRフリーHT

Nextera XT

Nextera XT

Nextera Mateペア

Nextera DNA

TruSeq Nano DNA HT

TruSeq DNA PCRフリーHT

TruSeq Nano DNA HT

TruSeq DNA PCRフリーHT

Nextera DNA