BaseSpaceトレーニング

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  • BaseSpace Informatics Suite:コホートアナライザーと相関エンジンの紹介

    録画ウェビナー(2020年1月)| BaseSpace−(* Informatics Suiteは、セキュアでスケーラブル、オープンなプラットフォームを使用してゲノムデータ管理、解析、レポート作成を簡素化します。イルミナのテクニカルサポートでは、多次元ゲノムデータの解釈とレポート作成を可能にするインフォマティクススイートのツールであるCohort AnalyzerとCorrelation Engineについてご紹介します。次のトピックを取り上げます:Cohort AnalyzerとCorrelation Engineの概要、Cohort AnalyzerとCorrelation Engineを使用した実験計画、Cohort AnalyzerとCorrelation Engineのデモ、ツールが研究プログラムにどのようにプラスの影響を与えるか。


  • BaseSpace Sequence Hub:サンプル管理のためのIlluminaクラウドベースソリューションの準備タブ

    録画ウェビナー(2015年12月) | このプレゼンテーションでは、生体サンプルの作成とインポート、カスタムライブラリー調製キットの作成、ライブラリーのインポート、ランとプロジェクトの違いの強調など、Prep Tabの基本機能について学習します。装置のセットアップ、新しいアプリの開発、プログラミングについては、このウェビナーでは説明しません。


  • BaseSpace Sequence Hub:データ解析のためのFASTQ処理ツール

    録画ウェビナー(2020年8月) | FASTQファイルは生物学的シーケンスと品質情報を保存し、下流のデータ解析パイプラインの鍵となります。最適なデータ解析を確実に行うために、FASTQ生成にはいくつかのステップが必要です。このウェビナーは、FASTQの処理に使用される基本的なバイオインフォマティクスツールのアウトプットを理解しようとする生物学者を含む、新規および中間ユーザーを対象としています。FASTQCやFASTQツールキット*などのBaseSpace Sequence Hubツールに焦点を当てます。 

    以下のトピックを取り上げます。FASTQファイルとは何か、イルミナFASTQ生成ツールの概要、アダプタートリミング、マスキング、品質トリミング、リードステッチなどのFASTQ処理、イルミナランパフォーマンスメトリクスとFASTQCなどのサードパーティツールによって生成される出力の違いを強調します。

    *BaseSpace Labsアプリは、従来のイルミナアプリよりも早く BaseSpace ユーザーが利用できるように、開発プロセスを加速して開発されています。イルミナは、独自の判断で BaseSpace Labsアプリのサポートを提供する場合があります。 BaseSpace Labsアプリは、いかなる種類の保証もなくAS-ISで提供されます。 BaseSpace Labsアプリは、ユーザーの単独のリスクで使用されます。イルミナは、 BaseSpace Labsアプリの使用に起因するデータの損失、不正確な結果、または費用、責任、損害について責任を負いません。


  • BaseSpace Sequence Hub:基本解析用のコマンドラインツール - パートI

    録画ウェビナー(2019年8月) | BaseMountおよびBaseSpace CLIは、コマンドラインインターフェースを介してBaseSpace Sequence Hubアカウントをナビゲートするためのツールです。これらのツールは、BaseSpaceでデータをアップロード、ダウンロード、表示する際の労力を大幅に削減します。このウェビナーは、コマンドライン環境で操作する知識を持つ上級のBaseSpaceユーザーを対象としています。このウェビナーでは、以下について話し合い、デモンストレーションを行います。BaseMountとBaseSpace CLIの違い、各ツールのインストールと要件、すべてのBaseSpace Sequence Hubアカウントタイプ(Basic、Professional、Enterprise)でツールを使用する方法、各ツールでデータをアップロードおよびダウンロードする方法、各ツールでデータフォルダーをナビゲートする方法。

    ご注意:BaseMountおよびBaseSpace CLIはアルファソフトウェアリリースです。機能と機能は時間の経過とともに変化する可能性があり、サポートはイルミナのソフトウェア開発から直接行われます。


  • BaseSpace Sequence Hub:基本解析用のコマンドラインツール - パートII

    録画ウェビナー(2019年6月) | BaseMountおよびBaseSpace CLIは、コマンドラインインターフェースを介してBaseSpace Sequence Hubアカウントをナビゲートするためのツールです。これらのツールは、BaseSpaceでデータをアップロード、ダウンロード、表示する際の労力を大幅に削減します。このウェビナーは、コマンドライン環境で操作する知識を持つ上級のBaseSpaceユーザーを対象としています。このウェビナーでは、以下について話し合い、デモンストレーションを行います。BaseMountとBaseSpace CLIの違い、各ツールのインストールと要件、すべてのBaseSpace Sequence Hubアカウントタイプ(Basic、Professional、Enterprise)でツールを使用する方法、各ツールでデータをアップロードおよびダウンロードする方法、各ツールでデータフォルダーをナビゲートする方法。

    ご注意:BaseMountおよびBaseSpace CLIはアルファソフトウェアリリースです。機能と機能は時間の経過とともに変化する可能性があり、サポートはイルミナのソフトウェア開発から直接行われます。


  • BaseSpace Sequence Hub:導入と解析の概要

    録画ウェビナー(2020年5月) | イルミナテクニカルサポートでは、イルミナのクラウドベースのシーケンスデータ解析ソリューションであるBaseSpaceについてご紹介します。このプレゼンテーションでは、BaseSpaceダッシュボードの操作方法、一般的なBaseSpaceの機能、アプリケーションとワークフローの活用を成功させるためのヒントとコツについて説明します。次のトピックを取り上げます。BaseSpaceでデータをアップロード/表示する方法、主要な解析ワークフローのディスカッション、BaseSpaceでデータを分析する方法の一般的な概要。

    ご注意:BaseMountおよびBaseSpace CLIはアルファソフトウェアリリースです。機能と機能は時間の経過とともに変化する可能性があり、サポートはイルミナのソフトウェア開発から直接行われます。


  • BaseSpace Sequence Hubによるランの準備

    このコースでは、BaseSpace Sequence Hub Prepタブを使用してシーケンスランのサンプル情報とパラメーターを入力する方法の概要を説明します。

    25分


  • メタゲノミクスパートII:解析の紹介

    録画ウェビナー(2021年3月) | メタゲノミクスシーケンスパートIの後、このウェビナーでは、メタゲノミクスにおけるデータ解析の紹介について説明します。イルミナのシーケンス技術に関する基本的な理解と、メタゲノミクスのライブラリー調製ワークフローに関する知識を前提としています。次のトピックについて話し合います:ターゲットメタゲノミクスとショットガンメタゲノミクス の概要、メタゲノミクスデータ解析 のオプション: BaseSpace Sequence Hub上の16sメタゲノミクスアプリとDRAGENメタゲノミクスパイプライン、BaseSpace Sequence Hub上のDRAGEN RNA病原体検出アプリ の概要。