アセンブリ | タイプ | リファレンスゲノムハッシュテーブル | ファイル名 | DRAGENの主要バージョン | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ハッシュテーブルバージョン | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 10 | 11 | |||||
CHM13 | パンゲノム(グラフ)リファレンス | Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v5 Pangenome | chm13_v2-cnv.graph.hla.methyl_cg.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||
Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v4 Multigenome | chm13_v2-cnv.graph.hla.rna-10-r4.0-1 |
10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v3 Multigenome | chm13_v2-cnv.graph.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
リニアリファレンス | Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v5 | chm13_v2-cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | ||||||||
Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v4 | chm13_v2-cnv.hla.methylated_combined.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [T2T] CHM13_v2 v3 | chm13_v2-cnv.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
アセンブリ | タイプ | リファレンスゲノムハッシュテーブル | ファイル名 | DRAGENの主要バージョン | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | |
ハッシュテーブルバージョン | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 10 | 11 | |||||
hg19 | パンゲノム (グラフ)リファレンス | Homo sapiens [UCSC] hg19 v5 Pangenome | hg19-alt_masked.cnv.graph.hla.methyl_cg.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 v4 Multigenome | hg19-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 v3 Multigenome | hg19-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 v2 Multigenome | hg19-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-8-r2.0-1.run | 8 | ✓ | ✓ | ||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 alt-masked Multigenome | hg19_alt_masked+cnv+graph+rna-8-r1.0-1 | 8 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 alt-aware Multigenome | hg19_alt_aware+cnv+graph+rna-8-r1.0-0 |
8 | ✓ | ✓ | ✓ | |||||||
リニアリファレンス | Homo sapiens [UCSC] hg19 v5 | hg19-alt_masked.cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | ||||||||
Homo Sapiens [UCSC] hg19 v4 | hg19-alt_masked.cnv.hla.methylated_combined.rna-10-r4.0-1 |
10 | ✓ | |||||||||
Homo Sapiens [UCSC] hg19 v3 | hg19-alt_masked.cnv.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 methylation v3 | hg19-alt_masked.methylated_combined.methylation.seed_len27-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [UCSC] hg19 v2 | hg19-alt_masked.cnv.hla.rna-8-r2.0-1 | 8 | ✓ | |||||||||
アセンブリ | タイプ | リファレンスゲノムハッシュテーブル | ファイル名 | DRAGENの主要バージョン | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | |
ハッシュテーブルバージョン | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 10 | 11 | |||||
hg38 | パンゲノム (グラフ)リファレンス | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v5 Pangenome | hg38-alt_masked.cnv.graph.hla.methyl_cg.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v4 Multigenome | hg38-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v3 Multigenome | hg38-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v2 Multigenome | hg38-alt_masked.cnv.graph.hla.rna-8-r2.0-1 | 8 | ✓ | ✓ | ||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 alt-masked Multigenome | hg38_alt_masked+cnv+graph+rna-8-r1.0-1 | 8 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 alt-aware Multigenome | hg38_alt_aware+cnv+graph+rna-8-r1.0-0 | 8 | ✓ | ✓ | ✓ | |||||||
リニアリファレンス | Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v5 | hg38-alt_masked.cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | ||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v4 | hg38-alt_masked.cnv.hla.methylated_combined.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v3 |
hg38-alt_masked.cnv.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 methylation v3 |
hg38-alt_masked.methylated_combined.methylation.seed_len27-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [1000 Genomes] hg38 v2 | hg38-alt_masked.cnv.hla.rna-8-r2.0-1 | 8 | ✓ | |||||||||
アセンブリ | タイプ | リファレンスゲノムハッシュテーブル | ファイル名 | DRAGENの主要バージョン | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | |
ハッシュテーブルバージョン | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 10 | 11 | |||||
hs37d5 | パンゲノム (グラフ)リファレンス | Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v5 Pangenome | hs37d5-cnv.graph.hla.methyl_cg.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5_chr v5 Pangenome | hs37d5_chr-cnv.graph.hla.methyl_cg.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v4 Multigenome | hs37d5-cnv.graph.hla.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v3 Multigenome | hs37d5-cnv.graph.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5 Multigenome | hs37d5+cnv+graph+rna-8-r1 | 8 | ✓ | ✓ | ||||||||
リニアリファレンス | Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v5 | hs37d5-cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | ||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5_chr v5 | hs37d5_chr-cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v4 |
hs37d5-cnv.hla.methylated_combined.rna-10-r4.0-1 | 10 | ✓ | |||||||||
Homo sapiens [NCBI] hs37d5 v3 | hs37d5-cnv.hla.rna-9-r3.0-1 | 9 | ✓ | |||||||||
アセンブリ | タイプ | リファレンスゲノムハッシュテーブル | ファイル名 | DRAGENの主要バージョン | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | |
ハッシュテーブルバージョン | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 10 | 11 | |||||
hg38-mm39 | リニアリファレンス | Homo sapiens [1000 Genomes] - Mus musculus [Gencode] - hg38-mm39 v5 | hg38-mm39-alt_masked.cnv.hla.methyl_cg.methylated_combined.rna-11-r5.0-1 | 11 | ✓ |
DRAGEN コンポーネント/パイプライン | リソースファイル | コンテンツ | 説明 | サイズ | 日付 | DRAGENの主要バージョン | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3.7 | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.1 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | ||||||
イルミナDRAGENハッシュテーブルビルダー(Pangenome Reference Generation) | CHM13-v2 Pangenome Reference Collection v5 | DRAGENマルチゲノムリファレンスを構築するためのmsVCF、FASTAファイル、グラフ除外.bedファイル、マスク.bedファイル、追加kmer.bedファイル(ファイル名「<FASTA>_graph_bed」) | DRAGENマルチゲノムリファレンスを再構築するには、同じリファレンスビルドから提供されるすべてのファイルを使用します。 DRAGENマルチゲノムリファレンスをカスタマイズするには、msVCFおよびその他のリソースファイルを使用します。 |
2.3 GB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||
hg19 Pangenome Reference Collection v5 | 2.1 GB | ✓ | ||||||||||||
hg38 Pangenome Reference Collection v5 | 2.1 GB | ✓ | ||||||||||||
hs37d5 Pangenome Reference Collection v5 | 2.1 GB | ✓ | ||||||||||||
CHM13-v2 Multigenome Reference Collection v4 | 2.1 GB | 2024年6月 | ✓ | |||||||||||
hg19 Multigenome Reference Collection v4 | 2.0 GB | ✓ | ||||||||||||
hg38 Multigenome Reference Collection v4 | 2.0 GB | ✓ | ||||||||||||
hs37d5 Multigenome Reference Collection v4 | 1.9 GB | ✓ | ||||||||||||
Illumina DRAGEN出力レポート | DRAGEN Output Reports rpm v4.4.4 - レポート | tar.gzのDockerイメージまたはrpmパッケージ | DRAGENの出力ファイルからリッチでインタラクティブな自己完結型HTMLレポートを生成するためのツールを提供します。 サマリーレポートは、主要メトリクスとフルレポートの比較サマリーです。 | 25 MB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||
DRAGEN Output Reports rpm v4.4.4 - 概要レポート | 14 MB | ✓ | ||||||||||||
DRAGEN出力レポート v4.3.6 | 147 MB | 2024年6月 | ✓ | |||||||||||
Illumina DRAGEN ML | DRAGEN ML Model v2.0 | MLモデルファイルv2.0 | バリアントコーリング中にDRAGEN MLが有効な場合に使用します。DRAGEN v4.0以降では、MLモデルはDRAGENに含まれます。 | 13.7 GB | ✓ | 1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 | |||
DRAGEN ML Model v3.1 | MLモデルファイル v3.1 | 13.7 GB | ✓ | 1 |
1 |
1 |
1 |
1 | ||||||
Illumina DRAGEN Somatic small variant calling - WGS, WES | SNV Somatic Systematic Noise v2.0.0 | hg19、hs37d5、hg38のノイズベースラインBEDファイルのコレクション - WGSおよびWES | DRAGEN Small バリアントコーリング-Somaticで使用 | 9.6 GB | ✓ | ✓ | ||||||||
SNV Somatic Systematic Noise v1.1.0 | 1.5 GB | ✓ | ||||||||||||
Somatic Systematic Noise Baseline Collection v1.0.0 | 1.9 GB | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |||||||
Illumina DRAGEN Somatic SV calling - WGS, WES | SV Systematic Noise Baseline Collection v3.1.0 | hg19、hs37d5、hs37d5-chr、hg38、WGS、FFPEサンプル/Heme固有のノイズベースラインBEDPEファイルのコレクション | DRAGEN SVコーリングで使用—Somatic | 185 MB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||
SV Systematic Noise Baseline Collection v3.0.0 | hg19、hs37d5、hg38、WGS、Hem固有のノイズベースラインBEDPEファイルのコレクション | 112 MB | 2024年5月 | ✓ | ||||||||||
SV Systematic Noise Baseline Collection v2.0.1 | hg19、hs37d5、hg38のノイズベースライン BEDPEファイルのコレクション - WGSおよびWES | 20.6 MB | 2023年7月 | ✓ | ||||||||||
SV Systematic Noise Baseline Collection v1.0.0 | 16 MB | 2022年7月 | ✓ | ✓ | ||||||||||
Illumina DRAGEN CNV - Germline Enrichmentパイプライン | CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome FFPE 2.5 - DRAGEN 4.4 v1.0 | Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentプロトコールにより、異なる組織タイプから45のFFPE良性隣接サンプルから生成されるPONで、NovaSeq 6000でシーケンスされます。 | 404 MB | 2025年5月 | ✓ | |||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome Mito 2.5 - DRAGEN 4.4 v1.0 | 54のサンプルから生成されるPON、ミトコンドリアゲノムエンリッチメントを伴うIllumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、質量でプール、オーバーナイトハイブリダイゼーション、NovaSeq 6000およびNextSeq 2000のシーケンス | 1.9 GB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 - DRAGEN 4.4 v1.0 | 54サンプルから生成されるPON、Illumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、質量でプール、オーバーナイトハイブリダイゼーション、NovaSeq 6000およびNextSeq 2000でのシーケンス | 1.9 GB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel - DRAGEN 4.3 v1.0 | エクソーム用のノーマル (PON) ファイルのパネルのコレクション(combined.counts.txt.gz) | 54のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、質量によるプール、夜間ハイブリダイゼーション、NovaSeq 6000およびNextSeq 2000でのシーケンシング。 | 4.4 GB | 2024年6月 | ✓ | |||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel - DRAGEN 4.2 v2.0 | 54のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、質量によるプール、夜間ハイブリダイゼーション、NextSeq 2000のみでのシーケンシング。 | 2.8 GB | ✓ | |||||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel - DRAGEN 4.2 v1.0 | 26のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentプロトコール、体積によるプール、夜間ハイブリダイゼーション、NextSeq 6000のみでのシーケンシング。 | 1.1 GB | ✓ | |||||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel - DRAGEN 4.0 v1.0 | 26のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentプロトコール、体積によるプール、夜間ハイブリダイゼーション、NextSeq 6000のみでのシーケンシング。 | 1.0 GB | ✓ | |||||||||||
CNV Panel of Normals for Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel - DRAGEN 3.10 v1.0 | 54のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、質量によるプール、夜間ハイブリダイゼーション、NextSeq 2000のみでのシーケンシング。 | 914.9 MB | ✓ | |||||||||||
CNV Panel of Normals for TruSight Hereditary Cancer Panel - DRAGEN 4.4 v1.0 | TruSight Hereditary Cancer Panel用のノーマルファイル (PON) のパネルのコレクション (combined.counts.txt.gz)。 これらのPONファイルはあらかじめ構築されています。最適な性能を得るため、ラボのプロトコールに最適なPONを独自に作成することを推奨しています。 |
42のサンプルから生成されたPON、Illumina DNA Prep with Enrichmentプロトコール、58℃でのハイブリダイゼーション、MiSeq、NextSeq 550、NextSeq 2000、NovaSeq 6000でのシーケンシング | 34 MB | 2025年5月 | ✓ | |||||||||
TruSight Hereditary Cancer Panel用のCNVノーマルパネル - DRAGEN 4.3 v2.0 | 41.8 MB | ✓ | ||||||||||||
CNV Panel of Normals for TruSight Hereditary Cancer Panel - DRAGEN 4.2 v1.0 | 30.2 MB | ✓ | ||||||||||||
Illumina DRAGEN CNV - Somatic TO(Tumor-only) や イルミナDRAGEN GermlineASCN CNV |
hg38 CNV Population SNP VCF v1.0 | 体細胞パイプラインのTumor-onlyワークフロー、およびASCN CNV生殖細胞系列パイプラインで使用される集団SNPのコレクション | Tumor-onlyのワークフローで使用されます。 生殖細胞系列ASCNワークフローで使用され、生殖細胞系列サンプル中のBアレルプロファイルを推定するために使用される候補部位を特定します。 |
1.8 GB | S | S | S | S | S | S | S | S | SおよびG | |
hg19 CNV Population SNP VCF v1.0 | 1.8 GB | S | S | S | S | S | S | S | S | SおよびG | ||||
hs37d5 CNV population SNP VCF v1.0 | 1.8 GB | S | S | S | S | S | S | S | S | SおよびG | ||||
CHM13-v2 CNV population SNP VCF v1.0 | 4.0 GB | S | S | SおよびG | ||||||||||
Illumina DRAGEN MSI | マイクロサテライトファイルv1.1.0 | DRAGEN WES/WGS体細胞パイプラインで使用されるDRAGENマイクロサテライトSiteファイルのコレクション。 | このバージョンでは、FFPEサンプルWGS/WESの正常パネルが追加されており、MSIサイトはさらにキュレーションされています。v4.2以降ではこのバージョンを使用することが推奨されます。 | 385 MB | 2025年5月 | ✓ | ✓ | ✓ | ||||||
Microsatellite Files v1.0.0 | 48 MB | 2024年5月 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |||
Illumina DRAGEN SNV Pipeline | Bed File Collection v1.0.0 | hg38、hg19、およびhs37d5のALU除外領域 bedファイルのコレクション | オプション--vc-excluded-regions-bedを備えたFFPEサンプルで使用するALU Bedファイル |
37 MB | 2024年5月 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
イルミナDRAGENターゲットコーラー | Targeted Caller Systematic Noise Baseline Collection v1.0.0 | hg38、hg19、およびhs37d5の系統的ノイズベースライン jsonファイルのコレクション | WESデータでターゲットコーラーとともに使用します。 | 138 MB | 2025年5月 | ✓ | ||||||||
Illumina DRAGEN MRJD | DRAGEN MRJD utility software v1.0 | readme、pythonスクリプト、MRJD領域 bedファイル、テストデータセットを含むtar.gzファイル | MRJDコーラー出力により、医学的に関連性があり困難な6つの遺伝子の相同領域におけるDRAGEN Small Variant Caller出力に代わるユーティリティソフトウェア | 115 KB | ✓ | ✓ | ||||||||
イルミナDRAGEN scRNA、CRISPR、scATAC イルミナDRAGENバルクRNA |
遺伝子アノテーションファイルコレクションv1.0 | 対応するゲノムアセンブリで使用するためのGTF遺伝子アノテーションのバージョンは、https://www.gencodegenes.org/。 各 アノテーションには、リファレンス染色体のみに包括的な遺伝子アノテーションが含まれます(足場、アセンブリパッチ、代替遺伝子座を除く)。 |
DRAGENソフトウェアの適応バージョンの検証とベンチマーキングに使用される遺伝子アノテーションインプット。 バルクRNAパイプライン用にテストされたgencode_hs37d5_chr.v19.annotation.gtf gencode.hg38_v44.mm39_vM30.annotation.gtf.gz はscRNAパイプライン専用にテスト済み gencode.v44.annotation.gtf.gz、 gencode.v19.annotation.gtfはすべてのパイプラインで テスト済みです。 必要に応じて、異なるアノテーションを使用することができます(例:異なるアセンブリや種)。 |
283 MB | 2025年5月 | 以前のバージョンについては、イルミナテクニカルサポートにお問い合わせください。 | ✓ | ✓ | ✓ | |||||
Illumina DRAGEN Population Haplotyping | hg38 Genetic Map v2.0 | 常染色体およびchr Xの遺伝子マップ、遺伝子マップ構成ファイル |
集団ハプロタイピングツールで使用し、集団データセットをフェーズ化し、ハプロタイプを推測します。出力は、インピュテーションに使用できるリファレンスパネルを構築します。 | 22.4 MB | 2023年7月 | ✓ | ✓ | ✓ | ||||||
Illumina DRAGEN Imputation | Imputation Reference Panel-IRPv2.1 | リファレンスパネル、遺伝子マップ、構成ファイル、バリアントサイトファイル | このリファレンスパネルには、常染色体とchrX、マルチアレルSNP、インデル、最高125Mのバリアントが含まれます | 20 GB | 2024年6月 | 2 |
2 |
✓ | ✓ | ✓ | ||||
Imputation Reference Panel-IRPv2.0 | このリファレンスパネルには、常染色体とchrX、多アレルSNP、インデル(<3% AF除去)、最高110Mのバリアントが含まれます | 18.5 GB | 2024年1月 | 2 |
2 |
✓ | ✓ | ✓ | ||||||
Imputation Reference Panel-IRPv1.2 | このリファレンスパネルには、常染色体、両アレルSNP、最高50Mのバリアントが含まれます | 8.2 GB | 2023年7月 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||||||
Illumina DRAGEN Hash Table Builder | CHM13-v2 Custom Multigenome Reference Collection v1.1.0 | FASTAリファレンスファイル、マスク.bedファイル、グラフ.bedファイル | DRAGEN v.4.0、DRAGEN v.4.1およびDRAGEN v4.2のカスタムマルチゲノムリファレンスの構築にのみ使用されます。 注:DRAGENマルチゲノムリファレンスは、これらのリソースファイルでは再構成できません。 |
1.1 GB | 2023年7月 | ✓ | ||||||||
hg19 Custom Multigenome Reference Collection v1.1.0 | 1.0 GB | 2023年7月 | ✓ | |||||||||||
hg38 Custom Multigenome Reference Collection v1.1.0 | 1.0 GB | 2023年7月 | ✓ | |||||||||||
hs37d5 Custom Multigenome Reference Collection v1.1.0 | 968 MB | 2023年7月 | ✓ | |||||||||||
hg19 Custom Multigenome Reference Collection v1.0.0 | 3.2 GB | 2023年7月 | ✓ | ✓ | ||||||||||
hg38 Custom Multigenome Reference Collection v1.0.0 | 3.2 GB | 2023年7月 | ✓ | ✓ | ||||||||||
hs37d5 Custom Multigenome Reference Collection v1.0.0 | 3.2 GB | 2023年7月 | ✓ | ✓ | ||||||||||
Illumina DRAGEN ORA Compression | ORA Compression Reference files for human data | リファレンスファイルとインデックスファイル | 最適化されたDRAGEN ORA(v3.10以降)による圧縮 - 通常のヒトデータ | 2 GB | 2022年3月 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |||
ORA Compression Reference files for human data | 通常のヒトデータの圧縮 | 1.5 GB | 2021年4月 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |||
ORA Compression Reference files for human bisulfite data | ヒトビスルファイトデータの圧縮(メチル化DNAのユースケース) | 5 GB | 2024年6月 | ✓ | ✓ | |||||||||
すべての種がサポートされているデータベース。V2は以前のバージョンと比較してDuckリファレンスを追加 | 特定の種のリソースファイルをダウンロードするには、以下の行を参照してください | 27 GB | 2025年5月 | ✓ | ✓ | |||||||||
3.7 | 3.8 | 3.9 | 3.10 | 4.0 | 4.1 | 4.2 | 4.3 | 4.4 | ||||||
ORA Compression Reference files for pig data | イノシシ | 2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for chicken data | ニワトリ | 986 MB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for rice data | イネ | 315 MB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for arabidopsis data | シロイヌナズナ | 110 MB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for wheat data | コムギ | 6.2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for cattle data | ウシ | 2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for soybean data | ダイズ | 685 MB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for rat data | ドブネズミ | 2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for maize data | トウモロコシ | 1 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for zebrafish data | ゼブラフィッシュ | 1.2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for mouse data | ハツカネズミ | 2 GB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for roundworm data | 線虫 | 92 MB | ✓ | ✓ | ||||||||||
ORA Compression Reference files for duck data | コブハクチョウ | 1.0 GB | ✓ | ✓ |
1:DRAGENインストーラーに同梱
2—DRAGEN v4.0およびv4.1と互換性がありますが、chXにインピュテーションはありません
S:体細胞パイプラインに利用可能
SおよびG:体細胞パイプラインと生殖細胞パイプラインで利用可能