MiSeq Reporterトレーニング

録画ウェビナー（2020年8月） | FASTQファイルは生物学的シーケンスと品質情報を保存し、下流のデータ解析パイプラインの鍵となります。最適なデータ解析を確実に行うために、FASTQ生成にはいくつかのステップが必要です。このウェビナーは、FASTQの処理に使用される基本的なバイオインフォマティクスツールのアウトプットを理解しようとする生物学者を含む、新規および中間ユーザーを対象としています。FASTQCやFASTQツールキット*などのBaseSpace Sequence Hubツールに焦点を当てます。 

以下のトピックを取り上げます。FASTQファイルとは何か、イルミナFASTQ生成ツールの概要、アダプタートリミング、マスキング、品質トリミング、リードステッチなどのFASTQ処理、イルミナランパフォーマンスメトリクスとFASTQCなどのサードパーティツールによって生成される出力の違いを強調します。

*BaseSpace Labsアプリは、従来のイルミナアプリよりも早く BaseSpace ユーザーが利用できるように、開発プロセスを加速して開発されています。イルミナは、独自の判断で BaseSpace Labsアプリのサポートを提供する場合があります。 BaseSpace Labsアプリは、いかなる種類の保証もなくAS-ISで提供されます。 BaseSpace Labsアプリは、ユーザーの単独のリスクで使用されます。イルミナは、 BaseSpace Labsアプリの使用に起因するデータの損失、不正確な結果、または費用、責任、損害について責任を負いません。

このコースを修了すると、MiSeq Reporterのすべてのワークフローに共通するデマルチプレックスおよびアライメントプロセスとプログラムインターフェースを理解できるようになります。また、サポートされているMiSeq Reporterワークフローの有用性についても簡単に説明することができます。 MiSeq Reporterは、MiSeq Control Software v2.6以前を使用する装置で利用できます。