録画ウェビナー(2020年8月) | FASTQファイルは生物学的シーケンスと品質情報を保存し、下流のデータ解析パイプラインの鍵となります。最適なデータ解析を確実に行うために、FASTQ生成にはいくつかのステップが必要です。このウェビナーは、FASTQの処理に使用される基本的なバイオインフォマティクスツールのアウトプットを理解しようとする生物学者を含む、新規および中間ユーザーを対象としています。FASTQCやFASTQツールキット*などのBaseSpace Sequence Hubツールに焦点を当てます。
以下のトピックを取り上げます。FASTQファイルとは何か、イルミナFASTQ生成ツールの概要、アダプタートリミング、マスキング、品質トリミング、リードステッチなどのFASTQ処理、イルミナランパフォーマンスメトリクスとFASTQCなどのサードパーティツールによって生成される出力の違いを強調します。
*BaseSpace Labsアプリは、従来のイルミナアプリよりも早く BaseSpace ユーザーが利用できるように、開発プロセスを加速して開発されています。イルミナは、独自の判断で BaseSpace Labsアプリのサポートを提供する場合があります。 BaseSpace Labsアプリは、いかなる種類の保証もなくAS-ISで提供されます。 BaseSpace Labsアプリは、ユーザーの単独のリスクで使用されます。イルミナは、 BaseSpace Labsアプリの使用に起因するデータの損失、不正確な結果、または費用、責任、損害について責任を負いません。
このコースでは、MiniSeq Control Software v1を使用するMiniSeq装置用のLocal Run Manager v1ソフトウェアの概要を説明します。トピックには、その目的、ソフトウェアへのアクセス方法、解析ワークフローが含まれます。また、シーケンスランを設定し、解析結果を表示する手順も示しています。
15分
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Recorded Webinar(2021年1月) | Local Run Managerは、ローカル解析オプションとランおよびユーザー管理を含むイルミナのベンチトップシーケンスデータ用のWindowsベースのソフトウェアです。装置外バージョンや装置制御ソフトウェアにバンドルされたバージョンなど、Local Run Manager v2のResearch Use Only(RUO)バージョンの概要を提供します。このウェビナーでは、Dxバージョンのソフトウェアは扱いません。Local Run Manager v2の機能、利用可能なバージョンと解析オプション、ランのセットアップとデータ解析の方法、装置上の制御ソフトウェアとの相互作用、その他のイルミナ解析ソフトウェアとの比較について取り上げます。
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録画ウェビナー(2021年2月) | MiSeq Windows 10のアップデートとMiSeq Control Softwareバージョン4で 起動するLocal Run Managerバージョン3は、ラン管理とデータ解析のためのWindowsベースのソフトウェアソリューションです。Local Run Manager v3はMiSeq Reporterに代わるもので、このウェビナーではLocal Run Manager v3の機能を紹介します。Local Run Manager v3の機能、ランのセットアップとデータ解析の方法、利用可能な解析ワークフロー、MiSeq Control Software V4との相互作用について取り上げます
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録画されたウェビナー(2021年5月) | ランによって生成されるデータの品質を評価し、理想的な出力に調整することは、シーケンスプロセスの重要な部分です。このウェビナーは、NextSeq 550シーケンスプラットフォームの新規ユーザーを対象とし、問題の表現型と根本的な原因を確認します。以下のトピックを取り上げます。NextSeq 550システムおよびNextSeq 2色ケミストリーの基本的な仕組み、NextSeq 550ランからの予測データ出力、NextSeq Control Software v4.0へのアップグレードに伴う変更、Sequence Analysis Viewerから収集できる重要なデータ、いくつかの一般的な問題表現型とその診断方法。
このコースを修了すると、NextSeq 550でランを開始するステップを特定し、試薬カートリッジの準備方法を説明し、NCSを使用してシーケンスランを開始することができるようになります。
20分
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